آزمایشگاه میکروبی با استفاده از آزمایش میکروبیولوژی، میکروارگانیسم های ایجاد کننده عفونت های مختلف را بررسی و آزمایش می کند. میکروسکوپ وسیله آزمایش اصلی آزمایشگاههای میکروبیولوژی است و آزمایشات مبتنی بر هرگونه رنگ آمیزی باکتریولوژیکی ، انگل شناسی و مستقیم یا فلورسنت با استفاده از میکروسکوپ در این آزمایشگاه ها انجام می شود.

میکروب‌شناسی یا ریززیست‌شناسی یا میکروبیولوژی (به فرانسوی: Microbiologie، میکروبیولوژی) (به انگلیسی: Microbiology، مایکروبایالوجی)، دانشی است که دربارهٔ شکل، ترکیب، ویژگی‌ها و بیماری‌زایی ریزسازواره‌ها (میکروارگانیسم‌ها) یا جانداران بسیار ریز بحث و گفتگو می‌کند.

میکروارگانیسم‌ها تغییرات مطلوب و نامطلوب در مواد غذایی پدیدمی‌آورند؛ و از طرف دیگر تهیه بسیاری از فراورده‌های غذایی بدون کمک میکروارگانیسم‌ها، امکان‌پذیر نیست. مانند کلم شور، زیتون رسیده و پنیر. اسیدهای حاصل توسط میکروارگانیسم‌ها و اضافه کردن آن‌ها به مواد غذیی مانند خیار شور آن‌ها را از گزند میکروارگانیسم‌های نامطلوب حفظ می‌کند. این بخش از میکروبیولوژی، امروزه کاربرد زیادی دارد.

آزمایشگاه میکروبی